无论太平洋东部还是西部的灰鲸，在史前时代都有被巨牙鲨猎杀的灰鲸纪录。20世纪初期，沿海土著捕鲸数降至较低水平，兴起的商业捕鲸造成的鱼类资源消耗，严重削弱了传统的渔猎经济。
19世纪中叶，潟湖育种区的商业捕鲸活动导致东太平洋灰鲸锐减，1855~1865年，十年高峰捕鲸期，每年捕获量约在480头。1967~1996年的调查显示，仅管有持续捕捞，东太平洋的灰鲸数量正以每年2.5%的增速恢复，1997年~1998年到达24,000-36,000头的高峰，2001~2002年，下降到15,000-22,000头，种群下降的原因解释繁多，最大可能与食物获取及环境承载力有关。西太平洋的灰鲸数量保持了过去水平，大约在100~300头左右。
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