如何根据RPKM值求差异表达基因

2025-04-06 05:43:45
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回答1:

t检验会出现比较对的假阳性,可以用fdr校正一下。如果没有生物学重复的话,建议用DEGseq。
也可以用edgeR包。read counts 需要联系给你做测序的公司,让他们提供一下。如果有服务器的话,亦可以自己跑一遍,不过比较费时间。