目前还不能解释所有生物进化过程。自然选择和进化论认为生物进化是循序渐进的、漫长的过程，不能很好地解释在地球亿万年的生物进化史中曾经几次出现的极短时间内突然有大量生物灭绝和新物种诞生蠢山段的现象。例如，著名的寒武纪生命大爆发、唯基二叠纪晚期生命大灭绝、白垩纪晚期生命大灭绝。事实上，达尔文自己也意识到这个问题，他曾经预言未来如果有生物学家挑战他的进化论，那么很可能就是以寒武纪生命大爆发为突破口。
这几次生命大爆发和大灭绝事件，实际上不能简单的局限在地球上进行解释，而是与天文因素密切带誉相关。太阳系围绕银河系运行一圈大约是2亿年，而这几次突发的生命大爆发、大灭绝间隔也是2亿年左右。
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