在东南海疆，美、日相继侵略台湾，中法战争中法军又向台湾、澎湖发动进攻，这使台湾的战略地位越来越受到重视。1886年，刘铭传、杨昌浚奉命会商台湾建省事宜，1887年在台北设立了台湾巡抚衙门，1888年刘铭传接受了“福建台湾巡抚关防”，台湾的人权、财权陆续确立，至此台湾建省的工作最后完成。到1895年，台湾设有三府一州，即台湾府、台北府、台南府和台东直隶州，辖11个县、4个厅。
