（1）分子是由原子构成的，根据水的化学式可知水分子是由氢原子和氧原子构成；
（2）物质属于宏观概念，元素也属于宏观概念，所以解释物质用元素来解释，二氧化碳是由碳元素和氧元素组成；
（3）水分子运动速度慢分子之间间隔减小，变为液态水，受热后水分子运动速度增加，水分子之间间隔增大，变为水蒸气，所以说水循环是水分子运动的结果．然界“碳循环”中的“碳”是指碳元素，是指碳原子这一类原子的总称．
故答案为：（1）氢原子和氧原子；（2）碳元素和氧元素；（3）水分子；碳元素．
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