A、在蝌蚪的变态发育过程中，与其尾部消失最密切相关的细胞器是溶酶体，因为溶酶体内含有许多种水解酶，能够分解很多种物质以及衰老、损伤的细胞器，A正确；B、细胞质中的DNA聚合酶和RNA聚合酶，通过核孔进入细胞核，B正确；C、结构[⑤]是高尔基体形成的囊泡，属于单层膜结构，磷脂的元素组成是C、H、O、N、P，腺苷的元素组成是C、H、O、N，C错误；D、从图示可知，细胞是一个有机的整体，D正确．故选：C．
