有机化学在环境科学中起着至关重要的作用。
1、有机化学给人类创造和维持了丰富多彩的物质生活，提高人们的生活质量。不仅在农作物改良、医药研究、食品工程方面发挥着重要作用，而且随着日益突出的环境问题在治理污染、环境生物监测等方面发挥着越来越重要的作用。
2、然而，人们要清醒的认识到有机化学是一把双刃剑，给人们提高生活质量的同时也造成了一些污染，不得不注意：
1）农业生产中，为了增产人们使用化肥。农药，这些物质都是有机合成物质，对我们环境及人类健康都造成严重影响。
2）室内环境中，有机化学在室内环境的影响，就是人们在室内装修的装饰材料的影响。人们忽略了一些新颖的建筑材料含有的有害成分释放出来会给室内环境能够造成污染。
3）自然环境中，汽车尾气的排放，汽车燃油是从石油的分馏、裂化等方式中得到的，正式有机化学的生产，有许多副产物，这些副产物对环境具有一定的破坏，因此，要控制化学副产物的产生，达到合理排放。
3、虽然传统有机化学影响了生态环境，但是也可以改善生态环境。例如：今天使用的煤为转化为清洁燃料，以减少在燃煤过程中产生的废气，达到排放标准，甚至达到零排放污染。这种手段就是利用化学原理，将煤中的元素原子100%转化成为人类有益的有机产物。在环境保护上提高能源的利用率，因此，开发绿色有机物对有机化学是一大挑战，有机化学就要担当起治理或减轻环境污染的重任。
有机化学在环境科学中具体应用措施：
1、充分调查，选择适宜的有机化学类型。
我国在改革开放的三十多年中，经济和社会危害，发展得到了显著的进步，但是，国语重视经济的发展，工业进程的加快，没有重视到化工业对自然环境造成的一定程度的污染和破坏。环境污染的污染源飞速增多，例如原有泄漏、燃煤烟尘、酸雨、汽车尾气、温室效应、有机氯农药、环境致癌物、雾霾、烟霾等。因此，在运用有机化学时，首要的任务就是对环境所存在的污染源进行准确识别。通过取样调查分析，明确污染源的类型和数量，指定准确的方案惊喜化学物质投放。做好对环境工程的调查，按要求选型可以应用的有机化学，这样，就可以规避污染源种类带来的危害，使化学制剂更具有针对性。
2、建立实验项目，准确把握有机化学的应用时效。
有机化学在环境工程的应用上，需要从多方面进行考量。有机化学在不同的环境治理上有不同的特殊要求和局限性。环境科学问题是一项长期的任务，需要环境科学人员坚持动态观察的工作方法。根据各地区污染情况的差异，环境科学部门要监理实验机制，通过对有机化学的认识了解，采用实验的方式进行实验组合，在实验中得出有效的结论。有机化学在环保上的应用需要更加谨慎，以有利于与环境维护为基础标准。
3、发展绿色化学，保障环保效果明显。
从环境工程工业发展来看，绿色化学是有机化学应用于环保的进步。绿色化学采用绿色技术，旨在提高废物的利用率，降低废物的数量和毒性。绿色化学是化工革命性的变化，能够继续推进绿色能源工业，绿色农业的发展。有机化学在应用过程中，需要从技术角度和专业化角度进行分析，通过实验得出结论，通过结论推广产生良好的环境治理效应。
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