A、一个ATP分子中含有2个高能磷酸键,A错误;B、ATP为直接能源物质,在体内含量不高,可与ADP在体内迅速转化形成,B错误;C、ATP分子由1个腺嘌呤和3个磷酸基及一个五碳糖组成,C错误;D、ATP与DNA均有C、H、O、P、N元素组成,故化学元素相同,D正确.故选:D.