医院位于深圳市南山区南山大道1112号（好来居大厦与中油酒店之间），附近的公交站有桂庙路口站、中油大厦站、南航公司站等，如果搭公交过来推荐在桂庙路口或是中油大厦站下车，如果在南航下的话大约还要步行约500米的距离。如自己驾车过来导航深圳建国泌尿外科医院或医院附近位置如中油酒店、桂庙路口公交站、海德二道、南航等等都行。
深圳建国医院公交路线：
桂庙路口站——74路、204路、331路、369路、390路、B699路、B813路、K105路、K204路、M206路、M222路、M239路、M241路、M242路、M371路、N4路、欧洲城假日专线
亿利达大厦站——204路、331路、332路、b699路、b813路、K105路、K204路、M206路、M222路、M239路、M242路、M371路、N4路、高峰12号专线、欧洲城假日专线
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