A、亲本产生配子时，成对的等位基因发生分离属于得出结论；故A错误．B、杂合子自交产生3：1的性状分离比属于提出问题；故B错误．C、两对相对性状杂合子产生配子时非同源染色体上非等位基因自由组合；故C错误．D、杂合子与隐性亲本杂交后代发生1：1的性状分离比，属于演绎推理；故D正确．故选D．
