《水浒传》的一百回和一百二十回版本存在以下差别：
1. 章节数量：一百回本共有100回，而一百二十回本则多出20回。
2. 章节名称：一百回本的26回名称变为“偷骨殖何九叔送丧，供人头武二郎设祭”，90回的标题是“五台山宋江参禅，双林镇燕青遇故”（燕青在第110回于秋林渡射雁）。而一百二十回本在征辽之后和征方腊之前有征田虎、王庆的情节，相应地，田虎、王庆的章节名称也与其他章节不同。
3. 故事情节：一百回本在征辽之后直接到征方腊，而一百二十回本在征辽之后和征方腊之间有征田虎、王庆的情节。并且，征田虎、王庆的情节明显是后增加的，是从上文柴进进入皇宫见到屏风上写的“四大寇”的情节衍生出来的。
4. 人物角色：一百二十回本多了琼英等降将。
5. 时间线：一百回本征辽胜利在宣和四年冬天，征方腊胜利在宣和五年九月。一百二十回本则将田虎、王庆两事强压硬塞进10个月里，导致时间线有一些不合理。
总体来说，一百回和一百二十回版本在章节数量、名称、故事情节、人物角色和时间线上存在一些差异。
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