使用log4j来输出日志。
一种方法是采用log4j输出到自己定义的日志文件中（参见：http://baike.baidu.com/link?url=dGdzMKBRrnAEe9R2fac08CB5hhWojk1GxW6-QRaykIuMV9zibrRMYMfMFyrmSW6fzrewewvBkrY7eeItuECiyK）；
一种方法是更换tomcat中的一些包，使用log4j来接管catalina.out的日志生成方式（参见：http://my.oschina.net/jsan/blog/205669）；
以上两种方法中，关于log4j的配置和日志记录方式都是一样的，只是使用log4j的方式不同而已，条条大路通罗马。
然后要在清空已有的日志记录的话，可以采用crontab定时检查日志文件名，remove掉就行。
可以用linux 系统自带的定时任务 crondtab
或者
专门的日志清理工具 logrotate
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