首先，了解一下为什么需要反编译apk
大部分情况下，是由于想本地化一款优秀的应用，才需要做这事儿；又或者进行少量的smali修改以达到想要的效果（如添加归属地，使3G版Nexus 7支持Wi-Fi热点）。
下面先准备运行环境和工具
建立工作目录，如.\workspace\apktoolbox （下面同样以此路径为例）
必不可少的JDK：Oracle Java下载，安装完成后把\bin添加到$PATH环境变量中
反编译和重编译工具apktool：Google Code下载，按平台下载（一个apktool-install---tar.bz2，一个apktool.tar.bz2，下载完成后解压至.\workspace\apktoolbox\bin
密钥文件，共4组。test/shared/media/platform，从android source中获取，分别对应不同共享用户ID时签名所需（查看应用AndroidManifest.xml第二行android:sharedUserId项 ），放到.\workspace\apktoolbox\bin下
test - 无android:sharedUserId项
shared - android:sharedUserId=android.uid.shared
media - android:sharedUserId=android.uid.media
platform - android:sharedUserId=android.uid.system
签名工具signapk.jar，放到.\workspace\apktoolbox\bin下
对齐优化工具zipalign（从android sdk中获取，在tools目录下），放到.\workspace\apktoolbox\bin下
准备工作完成
接下来就要开始工作了（以本地化工作为例）
把待反编译的apk放到.\workspace\apktoolbox\apks下
在命令行模式下进入.\workspace\apktoolbox\bin目录，输入以下命令进行解包（反编译）
apktool d ..\apks\.apk ..\apks\
.\workspace\apktoolbox\apks\\res下的values目录（英文原版）和values-r目录（本地化）就是需要的对象。
本地化工作完成后，在命令行中输入以下命令进行重新打包（重新编译）
apktool b ..\apks\
.\workspace\apktoolbox\apks\\dist目录下会生成重新打包后的apk（未签名，未对齐优化）
重新打包完成后，在命令行中输入以下命令进行签名（根据实际情况选用密钥，这里以test密钥为例）
java -jar signapk.jar testkey.x509.pem testkey.pk8 ..\apks\\dist\.apk ..\apks\_signed.apk
签名完成后，在命令行中输入以下命令进行对齐优化
zipalign -f -v 4 ..\apks\_signed.apk ..\apks\_zipaligned.apk
_zipaligned.apk就是最终需要的apk了。
完成
部分apk需要系统框架资源，没有的话在重新打包时会报错，这种情况下只需要先安装一下对应系统框架即可（从目标ROM中把/system/framework/framework-res.apk提取出，放到.\workspace\apktoolbox\apks下）。在命令行中输入以下命令进行安装
apktool if ..\apks\framework-res.apk
