你所谓的政府机关是什么单位？如果是女朋友，就没事儿。又不是老婆。不会查女方的；一般来说，国家安全机关的政审会比较严，但那也是审查配偶家里的情况，只是女朋友的话，一般不会影响。当然，如果人家非要找个什么理由把你给淘汰掉，那就不好说了
