是可以分开的，不过要看招标方标书内容，上面都有递交投标文件截止时间及开标时间，如果没有明确标明，可电话问询或者发函确认。至于没收投标保证金的问题，招标文件里也有，标书都会列出各种没收投标保证金的情况。迟到就没收投标保证金的话是不合规的，保证金不是订金，您可以与招标方沟通，如果仍不退可找律师咨询，通过法律途径解决。
