微生物检测的质量控制体系应包括：
1 样品的管理：样品应正确采样，并有充分的代表性，严格按照无菌操作要求采样，送检样品标识应具有唯一性，并做好样品的交接、登记、保存、处置等工作。送检样品检测越快越好，一般不超过3小时，避免样品保存时的污染、腐败变质，影响检测到准确性；
2 检测方法：微生物检测应按照国家卫生检验标准方法或其他实验室认可的方法进行；
3 检验过程：应严格按照无菌操作的方式进行。每个样品要做空白对照和平行样，以保证检测结果的可靠性；
4 报告制度：报告应包含有检验人、审核人、签发人签名。附有原始记录，保证结果的可靠性和可追溯性；
5 完善实验室管理：建立实验室内审制度，即时更新程序文件，不断提高卫生检验管理水平，完善实验室质量体系。
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