大多数边缘盆地具有大洋型地壳，边缘盆地上覆盖着陆源、火山碎屑或者是远海的沉积物，厚度在百米至数千米之间。在我国南海，海盆地壳厚度仅仅是5公里至8公里。而我国东海冲绳海槽的盆地地壳稍厚，属过渡型地壳或变薄陆壳。基底熔岩多类似于大洋盆地的拉斑玄武岩，或者是略带有岛弧熔岩的特点。而盆地内多见正断层、地堑等引张构造，盆缘常有陡崖。
