第一、他们的历史不同，农村商业银行的前身是农村信用社，机时城市商业银行的前身是城市信用社。第二、他们的定位是不同的，农商行定位一般定位于农村，扶持三农，还会承担一些农业方面的社会义务，及承担一些政策性的东西，也就是代理一部分农发行业务。而城商行定位于城市。
城市商业银行是由之前的城市信用社发展而来的，农村商业银行是由原来的农村信用社改制而来。城商行服务定位主要为城市，农商行主要定位于农村，扶持三农。
