我是交大医学院的生医工毕业的。医学院侧重的是医疗仪器，包括电路，放疗，图像等等方向，偏向于实际应用领域。感谢医学院的脑子秀逗领导，现在医学院的本科生物医学工程专业已经被取消了。生科院的生物医学工程是全国排名数一数二的专业，具体情况我不太清楚，你可以从交大的官方网站看看具体的情况。
医学院的侧重医学； 生科的那个已经独立出来成为单独的学员了 偏计算机科学和电子工程 。。
