我只能简单的说几句,扣车是警察方面扣的,虽然移交到烟草部门(只有烟草部门有权处理烟草方面的案件,但案情重大的,公安部门参与进来,最后,烟的处理权在烟草,至于拘留、判刑之类的归公安),车辆作为违法运输工具也应该移交到烟草部门,至于扣车手续,那应该是首先扣车方开具的,从你的情形看,拉的烟不会太少,也就是价值较高,你人当时应该被带去调查询问了,然后被扣的东西应该有个清单交给你的,也就是“先行登记保存通知书”。清单中一般应包含车辆,但也有不写的,因为你知道自己的车子在什么地方扣着。再,你不知情不代表不违法,烟草专卖法上有明文规定,即使在不知情的情况下,违法运输烟草专卖品也是违法的,等当地烟草与公安部门结案时,你的车辆会还给你的,当然,你要做好被罚款准备,因为,你违法了,罚款金额以你运输的烟草价值按比例计算,超过50000元以上处罚会重,但因你只是负责运输的,且不知情,处罚应该不会太重。还有,此类案件一般不会太长时间就会结案,结了案,自己还你车,你可以去当地烟草部门询问案件进展情况,真找不到货主,案件很快就结了,他们拖着不办,你就到烟草的上级部门去说明情况,烟草是垂直管理的,也就是县里直接归市里,市里直接归省里,省里直接归国家局管理,你到他们的上级部门反映结案时间就快了。记好,虽然案件可能移交公安部门,但,烟、运输工具处理权应该在烟草部门。