A、水分子内不含氢键，只存在与水分子之间，故A错误；B、甲醇分子内不存在氢键，甲醇分子间存在氢键，故B错误；C、N元素的电负性较大，DNA中的碱基互补配对是通过氢键来实现的，故C正确；D、H2O是一种非常稳定的化合物，与共价键有关，与氢键无关，故D错误．故选C．
