：（1）病原体不同。非淋菌性尿道炎的病原体是沙眼衣 原体和支原体、白色念珠菌、阴道毛滴虫等，而淋病的病原体是淋病双球菌。
（2）临床症状不同。非淋菌性尿道炎的临床症状是分泌物呈乳白色，以慢性尿道炎的形式表现出来；而淋病的开始症状是自尿道口流出大量黄色脓性分泌物，以急性尿道炎的形式表现出 来。
（3）治疗方法不同。非淋菌性尿道炎的治疗药物以四环素类、红霉素药物为主；而淋病的治疗药物以青霉素类、头孢菌素类药物为主。另外除了西药治疗，还有中药进行治疗，如藏药慧剑就是不错的，是专门针对泌尿系统疾病的药物。此外应多加强锻炼保持好的心态是抵抗疾病的有力武器。
淋球菌性因为感染的细菌是淋球菌，为数不多的革兰氏阴性球菌，对头孢和大环内脂类部分药物治疗敏感。以卡他性化脓性炎症为主要表现，症状较重，感染2-7天发病
非淋尿道炎是淋球菌以外的致病菌感染尿道引起的，以衣原体和支原体最为常见，症状较轻，不容易引起重视，所以成为目前最常见的性传播疾病，感染3-10天后发病，是导致不孕的主要原因之一。
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