无论真核还是原核表达系统，影响因素很多是类似的：1.外源基因类型，结构蛋白，膜蛋白还是功能性蛋白；2. 密码子优化情况；3. 启动子情况；4.产物对宿主细胞的影响；5. 表达产物的状态，正确折叠？分泌？修饰？6.宿主细胞的选择，工程化细胞删除了某些蛋白酶，利于产物稳定7.拷贝数或者插入类型的区别。
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