鲜黄花菜的花和根含有一种有毒的生物碱，其中雄蕊含有的毒素最多。食用可能引起食物中毒、恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状。新鲜的黄花菜在食用前需要解毒，所以食用干黄花菜更安全，因为其中所含的毒素在干燥过程中会被破坏。
人食用后，体内容易氧化产生有毒的秋水仙碱，导致中毒。研究发现，成人食用50-100g鲜黄花菜(含0.1-0.2mg秋水仙碱)会出现急性中毒症状，如口渴、咽干、恶心、呕吐等。严重者便血、血尿等。
扩展数据
黄花菜的花有健胃、催乳、补血的功效。如果哺乳期女性乳汁分泌不足，可以食用，可以促进泌乳，降低乳汁。根具有利尿和消肿的作用，可用于治疗水肿和排尿困难；叶可安神，可治疗神经衰弱、失眠、乏力和浮肿。习惯上各种萱草的根都入药，只有萱草的芽入药。
黄花菜有很好的健脑抗衰老作用，因为它含有丰富的卵磷脂，卵磷脂是体内很多细胞，尤其是脑细胞的成分。对增强和改善脑功能有重要作用，同时可清除动脉中的沉积物，对注意力不集中、记忆力减退、脑动脉阻塞等症状有特殊疗效，故人们称之为“健脑蔬菜”。
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