蛋白质的拓扑结构是指各二级结构元件（如α螺旋、β折叠等）的相继次序与其空间结构之间的关系，它也是我们将蛋白质结构进行分类、汇总以及比较的一个重要参考。蛋白质的拓扑结构在对蛋白质折叠过程的研究当中也起着重要的作用。
