公司叫拿增值税专用发票与公路，内河货物运输业统一发票去国税认证

先认证再抵扣，也就是先把抵扣联原件拿到国税局进行认证，认证通过后会拿到认证清单和抵扣联原件，这些都要回去做账用的，要和其他原始凭证归到一起做凭证。

网上申报系统因为各地版本不一样，所以操作没办法说的很细，具体操作可以到各地的办税服务厅里面的自助服务区看看，会有专门的人给你讲解的。

认证通过的增值税专用发票、海关完税凭证、运输发票，如果用于增值税应税项目就可以进行抵扣，这就看你的账务处理了，如果用于非增值税应税项目就不能抵扣，例如你是做皮鞋的，你买了毛皮用于个人穿戴或集体福利，就属于不得抵扣进项税额。
在网上报税的时候，需要用于抵扣的凭证号需要录入，然后选择用于当月抵扣（各地操作不一样），然后在报表里体现出相应的进项税额就行了。

抵扣联原件带过去，税务局会扫描认证，然后给你一份认证清单的。申报增值税的时候，进项就按照认证清单的合计数进行申报抵扣。
海关缴款书、货物运输专用发票，境外汇款完税凭证，这些都是可以作为进项抵扣的。

抵扣联带过去，扫描认证，认证完毕盖上某年某月某日已申报抵扣章，国税局同时打印一份已抵扣明细表给你，回来后在运输费用结算单据里进行相关操作，海关缴款书需要网上认证通过方可抵扣