按照化学组成，酶可以分为单纯酶和结合酶。
有些酶其活性仅仅决定于它的蛋白质结构，这属于单纯酶。
有些除了需要蛋白质（即酶蛋白）以外，还需要非蛋白质的小分子物质（即辅助因子），才有催化活性，这属于结合酶。
酶蛋白和辅助因子结合之后形成的复合物，称“全酶”。只有全酶才有催化活性。
全酶(holoenzyme):具有催化活性的酶,包括所有必需的亚基,辅基和其它辅助因子.
酶的辅助因子：就是辅助没发生作用的因子。
酶活性中心：酶分子中直接与底物结合，并和酶催化作用直接相关的部位。
尿素循环：又称为鸟苷酸循环，可以将来自氨和天冬氨酸的氮转化为尿素。该循环是发生在脊椎动物的肝脏中的一个代谢循环。
变构调节：指小分子化合物与别构酶的调节部位特异结合，引起酶蛋白分子构像变化、从而改变酶的活性。
磷氧比：呼吸过程中无机磷酸（pi）消耗量和氧消耗量的比值。
分子杂交：不同来源或不同种类生物分子间相互特异识别而发生的结合。如southern杂交、northern杂交、western杂交。
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