锈菌是一类专性寄生物，一般只侵染某些寄主（花卉）的同一属甚至一定的品种。但是花卉的锈菌中也有些具有转主寄生的特点，如为害贴梗海棠的梨胶锈菌（Gymnosporangium.asiaticum）、松芍柱锈菌（Cronartium.flaccidum）都是以松柏类为转主寄主的病害，即该菌是在松柏上越冬的，所以在城市附近及其他松柏类较多的地方发病重。
不同锈病菌的发病条件不完全相同，如菊花锈病菌的夏孢子在16～21℃，空气相对湿度高于85%最利于其发生与蔓延；萱草柄锈菌在旬均温度24～26℃，空气相对湿度高于85%有利于发生与蔓延。多数病菌遇夏季高温夏孢子易死亡，冬季温度过低，冬孢子也易死亡，所以冬季较长又较寒冷，夏季温度较高，病害不严重。如四季温暖多雨或多雾年份则发病重。当栽培管理差，栽种过密，通风不良，地势低洼，排水不良，土壤板结，土质黏重，施氮肥过多或缺肥及土质瘠薄等容易发病。反之，栽培管理得当，生长健壮的花卉，发病则轻。一些种类的花卉品种间的抗病力差异较大。
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