箱变的低压出口断路器设置目的是保护箱变；风机出口断路器的主要目的是保护发电机和变流器。两者的整定值是有一定差异的，箱变出口断路器的整定值大于风机出口断路器，当系统或发电机发生故障时一般先跳风机出口断路器，这样切断发电机和变流器后辅助电源可以继续工作，保证机舱的变浆、制动能正常工作（虽然一般有后备电源）。箱变的出口断路器也作为后备保护。
两个断路器的整定值均需要满足正常发电、短时过负荷以及低电压穿越时过电流不跳闸。一般双馈风机长延时可整定1.2倍额定电流、短延时1.5倍额定电流、速断4倍额定电流，时间按照允许过流时间整定，箱变出口断路器的整定值按以上适当放大。
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