用过的平皿必须要先用蒸汽高压灭菌，然后放置冷却，再将培养基等固体物质倒入垃圾桶，不能直接用水冲入下水道，以免堵塞，最后清洗培养皿，晾干。下次要使用前再重新杀菌。 这样做是出于生物安全的角度，避免未灭菌培养基中的活菌重新污染环境和人体。
