不同类别的船员服务机构，相互之间根本区别在于服务的船员类别、船舶国籍及船舶航行区域不同。
（1）内河船舶船员服务机构可为内河船舶提供配员，并为内河船员提供相关船员服务。
（2）乙级海船船员服务机构可为中国籍国内航行的海船提供配员，并为海船船员提供相关船员服务。
（3）甲级海船船员服务机构可为中国籍国际航行和国内航行海船提供配员，并为海船船员提供相关船员服务。
（4）海员外派机构可为外国籍或港澳台地区籍海船提供配员，并为海船船员提供相关船员服务。只有取得海员外派机构资质，方可从事海员外派活动。
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