保护区管理局内设三科一室二所(科技科、经营科、人事科、办公室、派出所、门票管理所),下设五个保护站、两个经济实体(旅游公司和林源公司)。保护区现有职工223人(其中离退休70人),有技术人员32人(其中高级工程师5人,工程师10人)。
鸡公山林场是中国建场历史较为悠久的基地之一,自建场以来,坚持封山育林,绿化荒山,引种驯化,发展林业,取得了显著的成绩。早在1920年代初期,中国林业老前辈韩安、英国林学家波尔登等林业工作者先后从北美、日本引种珍稀用材树种落羽杉、池杉、日本赤松、北美枫香等20余种;落羽杉、池杉引种推广到江南十几个省区,在造林绿化方面起到了巨大的作用。1949年后,又引种了柳杉、黄山松、火炬松、湿地松、水杉等优良的用材树种,对豫南地区林业生产起到了很好的示范和推动作用。1999年被国家林业局、环保局、农业部、国土资源部联合授予“全国自然保护区管理先进单位”,2001年7月被市委、市政府授予“国家级生态示范市建设窗口单位”,2002年被省旅游局授予“旅游资源开发与景区(点)管理先进单位”。
建立保护区后,组织多学科专家制定保护区的总体规划,对保护区的植物、动物、土壤、岩石、气候等进行了深入细致的调查,编制了《鸡公山木本植物图鉴》、《鸡公山自然保护区科学考察集》,建立健全了保护区交通、通讯设施以及防火控制和预报系统。建立了鸡公山自然博物馆、鸡公山山地树木园,与中科院联合建立了过渡带上的生态系统定位观测站,与大专院校、科研单位协作开展多学科的研究工作。建立了保护区对外宣传交流的网络系统,森林植被以及生物多样性得到了快速的恢复和有效的保护。开辟了生态旅游线路,建立了以武胜关为主体的生态经济林区。
保护区除有效的保护好这块过渡带保留完好的生态群落外,还积极开展多项生产试验和科学试验研究工作。在70年代以前,主要开展多种树种的引种繁育试验、森林病虫害的生物防治、植树造林等工作。1970年代以后,主要开展了:
①鸡公山山地树木园规划设计、引种驯化、引种试验等工作;
②南竹北移,毛竹播种育苗、造林,已有成林2000多亩;
③全国杉木地理种源试验,试验地面积140余亩,此项获国家科技进步二等奖;
④火炬松、湿地松种源试验,获省科技进步三等奖;
⑤“六·五”、“七·五”期间与林科院合作开展的国内主要用材树种的引种试验;
⑥国家一级保护植物珙桐、秃杉异地保存试验;
⑦落羽杉、池杉良种繁育基地建立和推广;
⑧森林生态系统定位观测;
⑨鸡公山自然博物馆中的各项生物标本的收集和制作;
⑩茶叶、板栗的丰产技术和新品种选育;①野生花卉的保护与繁育;②珍稀濒危物种的调查和繁育等。据不完全统计,保护区在科学研究方面获得省市级科技成果奖约20余次,在各级各类专业及综合刊物上发表论文近100篇。