政府规范性文件（既红头文件）和合同相抵触时，应该执行那个，和时间顺序有关系吗。

你好，政府规范性文件属于行政法规范畴内，具有法律的强制性和普遍适用性。而你说的协议应该是指劳动合同，劳动合同如果与法律法规相抵触，当然无效。但依据不是楼上回答者所说的《合同法》。劳动合同在《劳动合同法》中有详细规定，不能在适用《合同法》。
如果劳动者发现用人单位支付的工资低于最低工资标准，劳动者可以通过3种方式解决：一是与企业进行协商；二是可以向当地政府劳动争议仲裁机构申诉，通过调解仲裁方式解决；三是向劳动行政部门劳动监察机构举报，由劳动行政部门依法对企业违法行为调查处理。用人单位将承担相应的法律责任。用人单位违反最低工资标准，一般承担三种形式的法律责任：一是补足欠付职工的工资；二是劳动行政部门视具体情况责令企业向职工支付赔偿金；三是对企业罚款，罚款所得上交国家。

应该执行政府的，因为是法律授权地方政府对最低工资标准作出规定，当事人之间的协议不能违反强制性规定。

协议约定的该条款无效

根据《合同法》第五十二条有下列情形之一的，合同无效：
　　（一）一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益；
　　（二）恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益；
　　（三）以合法形式掩盖非法目的；
　　（四）损害社会公共利益；
　　（五）违反法律、行政法规的强制性规定
法规授权地方政府对最低工资标准作出规定，当事人之间的协议不能违反强制性规定。 约定违反的，应属无效，因此700元的标准应属无效条款，你可以政府规定主张公司支付1000元的最低工资。