（1）由于B组中肺炎双球菌在煮沸情况下失去活性，又由于加入D试管中的是S菌的DNA，能使部分R菌转化成S菌，所以能导致小鼠死亡的是AD两组．
（2）B组煮沸的目的是利用高温将有荚膜的细菌杀死，使其失去毒性．
（3）由于加入E试管中的是S菌的蛋白质，而加入D试管中的是S菌的DNA，因而通过D、E两组对照，能说明转化因子是DNA而不是蛋白质．
（4）由于加入D试管中的S菌的DNA，能够进入R菌体内，与R菌的DNA重组，因而能将有荚膜的性状遗传给后代．
故答案为：
（1）A、D
（2）将有荚膜的细菌杀死，失去毒性
（3）DNA是转化因子，蛋白质不是
（4）能
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