蓝天救援实行队长负责制，蓝天救援的发展理念、纪律、制度、服装、标识和大型救援行动实行全国统一标准化、垂直化管理。蓝天救援总部拥有蓝天救援品牌和标识的所有权和认证考核权，全国各地蓝天救援分支队伍的申请组建与考核，队长、联络官的选拔与考核，蓝天救援品牌标识的授权认证与使用等由蓝天总部直接审核、管理、任命和授权。
