没必要两边都交的，毕竟社保在一个城市买就行了。而且你现在在南京上班，深圳的就先不要管了，不然你两边都交很吃力的，个人缴纳社保最少都1300左右了，全部都自己缴纳哦。除非你深圳的快满15年，不然就不要考虑了。另外你现在在南京工作，以后只能是深圳转去南京，南京不可以转去深圳了。以后的社保政策具体怎样的还不确定，建议不着急的暂时先不要管，说不定以后真的一卡通呢。反正现在先把南京的社保处理好就可以。
