A、一个种群中基因型频率的改变，不一定导致该种群的基因频率发生改变，如自交后基因型频率和基因频率的变化，A错误；
B、同种生物两个种群的基因库出现差异，不一定是自然选择的结果，还有基因突变、迁入迁出等，B错误；
C、环境条件引起的变异，若是不遗传的变异，则不能为生物的进化提供原材料，C错误；
D、不同物种之间，生物与无机环境之间，在相互影响中不断进化和发展，一个物种的形成或灭绝，会影响到若干其它物种的进化，D正确．
故选：D．
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