①苹果套袋后用药间隔时间过长。苹果套袋后，多数果农认为果实进入了“保险箱”，打药只是为了保叶，将用药的间隔拖得很长。调查发现，套袋后一般都连续喷2～3遍波尔多液，间隔期一般在25～30天以上，个别农户间隔期达到40天。此期(6～8月份)正是腐烂病集中传播时期，由于喷药间隔期过长，给病菌传播提供了条件，这是造成苹果腐烂病呈上升趋势的重要原因。
②树体负载量过大。由于近几年苹果价格较高，果农舍不得疏花疏果，产量过高，加之其他管理措施跟不上，造成大小年结果严重，树势衰弱，抗病性差，加重了苹果腐烂病的发生。
③肥料投入不足，结构不合理。调查发现，果园粪肥不足，特别是磷、钾肥不足，是导致树势衰弱，诱发腐烂病严重的主要因素之一。另外，很多果农习惯于在雨季追施氮肥促果个，造成果树秋季旺长，贮备营养不足，树势旺而不壮，也导致了腐烂病的严重发生。
④清园药剂使用不当，病斑刮除治疗不及时。对树上的腐烂病斑和腐烂枝没有及时刮除、剪掉，有的把病残枝堆积在果园里及其附近，造成大量病菌积累。
⑤冻害也是诱发病害发生和流行的重要因素。
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