根用芥菜自播种到肉质根收获，依品种和各地气候情况而定，一般肉质根已充分膨大至花苔即将出现之前采收。成熟的标志为：基叶已枯黄，根头部由绿色转为黄色。采收时用锄将根用芥菜挖起，再用利刀削去茎叶的侧根，即可运往市场或加工厂出售。
