默认安装的linux都有图形界面啊， 你吧默认启动级别该成5 重启下就行了
……没有用过Linux，不过mathematica不一定要使用它的图形用户界面的啊，Windows下面，在它的安装文件夹里，有一个MathKernel，还有一个math，这两个都不是GUi吧（大概……我对相关概念不熟悉。）
命令行下输入math即可在纯命令行下运行mathematica.用java调用之类的不太清楚,应该是要学习JLink的.
