试根据一段序列设计一对pcr引物,并在两端加上两个限制性酶切位点

额,这是老师给的考试题库,题目就是这个了。
2025-02-23 19:08:35
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回答1:

一般是相对于双链DNA设计引物。你拿到序列后,选择正链序列作为模板(一般标记为 r )。然后用 primer 或者DNAman 分析序列里面是否有你想用的限制性酶切位点,有则需换序列中不存在的酶切位点。确定了上下游的酶切位点酶切位点之后,就可以用Oligo 设计引物,当然,高手的话也可以直接写。一般引物包括: 连接成线原件(也就是一段和模板连互补配对的序列,便于特异性的识别PCR起始位点,经常去12-20个碱基就好)、限制性酶切位点、保护碱基(方便限制性内切酶发挥作用,一般加3个碱基)。引物的长度最好控制在20-30bp。设计的引物经Oligo 评估觉得可以的话,就OK了。一般的指标主要是 GC%、Tm、引物二聚体分析、引物发夹结构,等等。百度一下,主要的几个指标达标就行了。如需帮助,可Hi我...

回答2:

那你就去找一段序列,在两边设计引物,在引物的5端挂上酶切位点序列,P完之后就能链接进去