高压蒸汽灭菌器采用湿热灭菌法，在同样温度下，湿热的杀菌效果比干热好，有以下原因。
1。蛋白质凝固所需的温度与其含水量有关，含水量越大，发生凝固所需的温度越低。湿热灭菌时的菌体蛋白质可吸收水分，因而比在同一温度的干热空气中更易于凝固。
2。高压蒸汽灭菌器湿热灭菌过程中蒸汽放出大量潜热，进一步提高温度。在同一温度下，湿热灭菌所需时间比干热短。
3。湿热气体的穿透力比干热气体强，故湿热比干热收效好。高压蒸汽可以杀死一切微生物，甚至包括细菌的芽孢，真菌的孢子等耐高温的个体。灭菌的蒸汽温度随蒸汽压力增加而升高，通过增加蒸汽压力，灭菌时间可被大大缩短。因此它是一种最有效，使用最广泛的灭菌方法。
水分子能渗透进生物细胞内部，能促成蛋白质、DNA分子断裂变性。
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