如果是小变更，例如仅仅是某个数字的变更，可以直接在原合同中进行变更、修改，并由双方的授权代表在变更处签字确认，盖章更没问题！如果变更较大，变更内容较多。建议双方签署合同补充协议。
针对变更的内容，双方签署补充协议，并注明该协议是XX合同的补充协议，是该合同不可分割的一部分。
签补充协议，或者双方确认的物料确认单。一般合同都会有规定按实际发生的为准的吧。不知道你具体要变更的是什么
