学费留学基金委是不管的，他们只资助生活费。国家公派留学生分为两类：
联合培养博士
公派出国攻读博士学位
联合培养博士到国外学校不上课（只做科研工作），因此不需要交学费，拿的学位仍然是国内学校的学位，申请的时候必须是已经是正在攻读国内大学的博士学位，或者被国内大学的录取为博士生。
公派出国攻读博士学位，要在国外学校上课，学费一般会减免。留学基金委要求申请资助出国攻读博士学位的候选人必须拿到国外录取学校的减免学费证明，否者不具有资助资格，因为他们只资助每月的生活费，不资助学费。
一般由留学基金会负担 要交保证金的
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