A、无氧呼吸的第一阶段与有氧呼吸的第一阶段相同，都有[H]的生成，第二阶段没有[H]的生成，A错误；B、有氧呼吸过程产生的[H]的作用是在线粒体内还原氧气生成水，B正确；C、硝化细菌等微生物可以利用氧化无机物产生的能量合成有机物而进行化能合成作用，C正确；D、有氧呼吸过程中O2在线粒体内膜上与前两个阶段产生的[H]反应生成水，D正确．故选：A．
