A、孟德尔实验后提出“为什么F1只有显性性状、F2又出现隐性性状？”等问题，故A正确；
B、“豌豆在自然状态下一般是纯种”不属于孟德尔假说的内容，是孟德尔取得成功的原因之一，故B错误；
C、“测交实验”是对推理过程及结果进行的检验，即演绎推理F1产生配子时成对遗传因子分离，则测交后代会出现两种性状，比例接近1：1，再设计测交实验对分离定律进行验证，故C正确；
D、“生物性状是由遗传因子决定的、体细胞中遗传因子成对存在”属于假说内容，故D正确．
故选：B．
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