工资超过5000怎么扣税

根据你的问题，首先，工资个税的计算公式为：个人所得税=[税前收入-5000元(起征点)-专项扣除(三险一金等)-专项附加扣除-依法确定的其他扣除]×适用税率-速算扣除数
个人所得税专项附加扣除包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等6项。纳税人赡养一位以上(包括一位)年满60岁老人的，即可享受。其中独生子女每月2000元，非独生子女可采取三种分摊方式(均摊，约定分摊，指定分摊)，但不管哪一种，最多不能超过每人每月1000元标准。
子女教育费按照每个子女每月1000元的标准定额扣除。纳税人在主要工作城市没有自有住房而发生的住房租金支出，可以按照以下标准定额扣除：
(一)直辖市、省会(首府)城市、计划单列市以及国务院确定的其他城市，扣除标准为每月1500元；
(二)除第一项所列城市以外，市辖区户籍人口超过100万的城市，扣除标准为每月1100元;市辖区户籍人口不超过100万的城市，扣除标准为每月800元。市辖区户籍人口，以国家统计局公布的数据为准。

【法律依据】根据《国家税务总局关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》(国税发〔2005〕9号)第二条规定：“纳税人取得全年一次性奖金，单独作为一个月工资、薪金所得计算纳税，并按以下计税办法，由扣缴义务人发放时代扣代缴：将雇员当月内取得的全年一次性奖金，除以12个月，按其商数确定适用税率和速算扣除数。如果在发放年终一次性奖金的当月，雇员当月工资薪金所得低于税法规定的费用扣除额，应将全年一次性奖金减除‘雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额’后的余额，按上述办法确定全年一次性奖金的适用税率和速算扣除数。”