查账的目的是检查你公司的的经营和税款缴纳情况。经营情况涵盖面很多，大概有几十项，例如，收入是否全部入账，已发出库存商品是否全部开票，会计科目的使用是否符合会计法的规定....等等。
一般来讲，国税局检查的主要是有关国税的增值税和所得税这两项税款缴纳的情况。增值税虽然可以有抵扣，但在实际工作中，都有似乎潜规则的规定，由于不知道你是哪个城市的，所以具体数字不能给你确定。但是就按税赋1%来计算的话，你公司已开出1000万的票，也要缴纳10万元的增值税了。至于企业所得税，要看你公司的规模了，即便是小单位，今年也对亏损和微利的企业特别关注，所以适当的时期要注意税款的缴纳。
不能详尽的写在这里，还希望对你有所帮助。
记账必须有正规的发票才行，收据是不合法的，如果查你，肯定罚款了，国税检涉及到增值税和所得税，
应该会罚款的，你看下《中华人民共和国发票管理办法》第三十六条
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