工合肥学院建筑工程系 工业与民用建筑、建筑学、新型建筑材料、房地产经营与管理、房屋建筑工程等本专科专业。现有土木工程和工程管理两个本科，房地产经营与估价和建筑工程技术两个专科专业
生物与环境工程系 设有生物工程、生物技术、环境工程、食品科学与工程本科专业，主要研究领域涉及微生物酶学、固态发酵理论研究、海洋天然产物研究、农产品贮藏与加工研究和环境生物工程研究五大领域
化学与材料工程系 化学工程与工艺专业、无机非金属材料工程专业、化学工程与工艺专业
计算机科学与技术系 计算机科学与技术专业、网络工程专业、网络系统管理专业、计算机控制技术专业
电子系 电子信息工程专业、自动化专业
机械工程系 机械设计制造及其自动化专业 机械设计制造及自动化 材料成型及控制工程专业
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