可以起诉医院,依法客观事实开据出生证明是医院的责任,但是重庆计生部门会以未婚先孕对你们进行处罚,具体数额根据当地收入情况而定。
卫生部的政策是不需要结婚证和准生证的,如果湖北这么搞,你可以打他们卫生厅妇社处的电话咨询一下,是不是地方的土政策。另外,计生政策即将改变,你可以等几年再去开出生证,或许医院就能开了